Une porte d'entrée : Lyonbiopôle, labellisé pôle de compétitivité mondial en 2005, est un centre d'excellence mondial en diagnostics et vaccins. Il se positionne comme une usine à projets collaboratifs pour développer un bouclier sanitaire contre les maladies infectieuses humaines et animales ainsi que les cancers.
Lyonbiopôle travaille avec l'ensemble des acteurs scientifiques, cliniques et industriels régionaux (grands groupes, PME et startups) afin de monter des projets de R&D multi partenariaux avec pour objectif de proposer des approches diagnostiques, préventives et thérapeutiques innovantes et leurs systèmes d'administration, pour une médecine plus réactive et personnalisée.
Lyonbiopôle accompagne également le développement des PME du territoire (R&D, international, Business Development, financement...).

Des industriels leaders : Sanofi Pasteur : n°1 mondial du vaccin humain, Merial : n°1 mondial des produits vétérinaires, bioMérieux : n°1 mondial du diagnostic bactériologique.

Des centres de recherche internationaux : Centre OMS de surveillance et de réponse aux maladies transmissibles (CSR), Centre d'Etude de Recherche en Virologie et Immunologie (CERVI).

De grands  équipements : le laboratoire P4 Jean Mérieux.

Un Réseau Thématique de Recherche Avancée (RTRA) : "Innovations en Infectiologie" (FINOVI), labellisé en 2006.

Une porte d'entrée : le CLARA (Cancéropôle Lyon Auvergne Rhône-Alpes) fédère et valorise les forces scientifiques, cliniques et industrielles en oncologie des régions Auvergne et Rhône-Alpes, au service de la recherche et de l'industrialisation des innovations pour le bénéfice du patient.
Le CLARA a développé 3 axes prioritaires : (I) Echappement tumoral, plasticité cellulaire et thérapies ciblées, (II) Infections et Cancer, (III) Nanotechnologies, imagerie et cancer et 3 axes émergents : (A) Evaluation, perception des risques et prévention du cancer, (B) Environnement, nutrition et cancer, et (C) Hadronthérapie and cancer.
Le programme Preuve de Concept, permettant le financement des phases amont de projets de R&D portés par des entreprises innovantes, a été créé à Lyon grâce à l’aide financière du Grand Lyon.

Des établissements hospitaliers dédiés au Cancer : Le Centre régional de lutte contre le cancer Léon Bérard, les CHU de Lyon dont le pôle d’hémato-oncologie de Lyon Sud, ou encore l’institut d’hématologie et oncologie pédiatrique.

Des centres de recherche internationaux : le CIRC (Centre International de Recherche sur le Cancer), le CRCL (Centre de Recherche en cancérologie de Lyon)

Un Réseau Thématique de Recherche et de Soins (RTRS) : « Synergie Lyon Cancer », labellisé début 2007.

La région Rhône-Alpes est l'un des rares pôles en Europe à couvrir tous les champs des neurosciences et des sciences cognitives, avec un potentiel exceptionnel en neuro-imagerie pour la recherche ou la clinique, l'Homme ou l'animal.

Une porte d’entrée : Le Réseau Thématique de Recherche et de Soin RTRS Neurodis « handicap neurologique » a été labellisé en 2007. Il rassemble des équipes de chercheurs et médecins de niveau international, fédérés autour d’un même objectif scientifique et médical, soit plus de 800 acteurs de la recherche (chercheurs de l’Inserm et du CNRS, professeurs d’université, médecins des hôpitaux, ingénieurs et techniciens, doctorants et post-doctorants).

Un établissement hospitalier, unique en Europe, dédié aux maladies neurologiques : l’Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer, Lyon.

Des centres de recherche fondamentale et appliquée : Le Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL) et l’Institut des Sciences cognitives (ISC).

Des plateformes technologiques spécialisées : Une plateforme complète d'imagerie multimodale : le CERMEP ; une plateforme de collections d’échantillons biologiques couplés aux données cliniques : NeuroBioTec.

Projet IDEE de création d'un institut spécialisé en épilepsies à Lyon (recherche, soin, association de patients, industriels).

La région compte plus de 300 entreprises actives dans le domaine des technologies médicales. Cette richesse industrielle nait de transversalités fortes avec des pôles industriels majeurs de Rhône-Alpes : plasturgie/santé, nanotechnologie/santé, micromécanique/santé, microelectronique/santé, optique/santé.

Une porte d’entrée : Le réseau I-Care (Health Technology Rhône-Alpes Cluster) se donne pour mission d’appuyer les entreprises régionales, afin de mettre la technologie et l’innovation au service du soin et de la santé, pour contribuer au progrès médical.
Cette initiative s'adresse à tous les acteurs appartenant à la chaîne de valeur des technologies de la santé de la région Rhône-Alpes : entreprises sous-traitantes, producteurs ou distributeurs, universités, centres de recherche, administrations, associations...